crazyhottommy/getting-started-with-genomics-tools-and-resources
این پروژه مجموعه‌ای از ابزارها و منابع برای شروع کار با ژنومیکس و علم داده است که از ابزارهای Unix، R و Python استفاده می‌کند.
کاربرد:
این مجموعه به محققان و دانشجویان کمک می‌کند تا با ابزارهای ضروری برای تحلیل داده‌های ژنومی آشنا شوند و بتوانند داده‌های بیولوژیکی را پردازش، تحلیل و بصری‌سازی کنند.
در چه شرایطی بهتره استفاده شود؟
وقتی می‌خواهید وارد حوزه ژنومیکس و بیوانفورماتیک بشید و نیاز به راهنمای گام‌به‌گام برای استفاده از ابزارهای خط فرمان و زبان‌های برنامه‌نویسی دارید. همچنین برای کسانی که روی داده‌های بزرگ ژنی کار می‌کنند و به دنبال روش‌های کارآمد برای مدیریت و تحلیل داده هستند عالیه.
چند مثال از موارد استفاده:
- پیش‌پردازش داده‌های RNA-seq با ابزارهای Unix
- تحلیل داده‌های ژنتیکی با کتابخانه‌های Python مثل Biopython
- رسم نمودارهای تحلیلی با R و ggplot2
- خودکارسازی فرآیندهای تحلیلی با اسکریپت‌نویسی در محیط ترمینال ️
- ##genomics
- ##bioinformatics
- ##data
- ##python
- ##R
- ##Unix
- ##NGS
- ##Biopython
- ##ggplot2
- ##computational